ネタバレを含みますので、未クリアの方はご注意ください。
クロノ・トリガーの物語は全26章に分かれています。時代を行き来する構成なので、いま自分がどこにいて次にどこへ向かうのかを見失いやすいゲームです。
このページでは26章を進行順に並べ、各章の時代・主な舞台・出現するボスをまとめました。数値と名称は DS版およびリマスター版（スマホ版・Steam版など）のものです。
目次
全26章の進行チャート
| 章 | 章名 | 時代 | 主な舞台 | 出現するボス |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 旅立ち！夢見る千年祭 | 現代 A.D.1000 | トルース町／リーネ広場／クロノの家／ルッカの家 | ゴンザレス |
| 2 | 帰ってきた王妃 | 中世 A.D.600 | トルース村の裏山／トルース村／ガルディアの森／ガルディア城 | — |
| 3 | 消えた王女 | 中世 A.D.600 | マノリア修道院／ガルディア城 | ヤクラ |
| 4 | ただいま！ | 現代 A.D.1000 | ルッカの家 | — |
| 5 | 王国裁判 | 現代 A.D.1000 | ガルディア城／空中刑務所／ガルディアの森 | ドラゴン戦車 |
| 6 | 廃墟を越えて… | 未来 A.D.2300 | バンゴドーム／トランドーム／16号廃墟／アリスドーム／32号廃墟／地下水道跡／プロメテドーム | ガードマシン、クロウリー様 |
| 7 | 不思議の国の工場跡 | 未来 A.D.2300 | プロメテドーム／工場跡 | Rシリーズ |
| 8 | 時の最果て | 時の最果て | 時の最果て | — |
| 9 | 魔の村の人々 | 現代 A.D.1000 | メディーナ村／ボッシュの小屋／ヘケランの洞窟 | ヘケラン |
| 10 | 現れた伝説の勇者 | 中世 A.D.600 | ゼナンの橋／サンドリノ村／お化けガエルの森／パレポリ村 | ビネガー（1回目）、ジャンクドラガー |
| 11 | タータとカエル | 中世 A.D.600／現代 | デナドロ山／タータの家／パレポリ村／ボッシュの小屋 | グラン＋リオン、グランとリオン |
| 12 | 赤い石 めずらしい石 | 原始 B.C.65000000 | 不思議山／イオカ村 | — |
| 13 | 足跡！追跡!! | 原始 B.C.65000000 | まよいの森／恐竜人アジト | ニズベール |
| 14 | 戦え！グランドリオン | 現代／中世 A.D.600 | ボッシュの小屋／魔岩窟／お化けガエルの森 | — |
| 15 | 決戦！魔王城!! | 中世 A.D.600 | 魔王城 | ソイソー、マヨネー、ビネガー（2回目）、魔王（1回目） |
| 16 | 気がつけば原始 | 原始 B.C.65000000 | イオカ村／ラルバ村のやけ跡／プテランの巣 | — |
| 17 | 大地のおきて | 原始 B.C.65000000 | ティラン城／ティラン城跡 | アザーラ＋ブラックティラノ |
| 18 | 魔法の王国 ジール | 古代 B.C.12000 | エンハーサ／カジャール／黒鳥号乗り場／ジール宮殿 | — |
| 19 | とけよ封印 呼べよ嵐 | 原始→時の最果て→未来→古代 | ティラン城跡／監視者のドーム／地の民の洞窟／ドロクイの巣 | — |
| 20 | なげきの山の賢者様 | 古代 B.C.12000 | なげきの山 | ギガガイア |
| 21 | 天空で待つものは | 古代 B.C.12000 | 地の民の洞窟／ジール宮殿 | ダルトン |
| 22 | ラヴォスの呼び声 | 古代 B.C.12000 | ジール宮殿／海底神殿／残された村 | ラヴォス（外殻） |
| 23 | 古代の新王 | 古代（崩壊後） | 残された村／黒鳥号／北の岬 | ダルトンR、マスターゴーレム |
| 24 | 時の卵 | 古代／現代／時の最果て／未来 | 時の最果て／死の山／監視者のドーム | — |
| 25 | 運命の時へ… | 4つの時代すべて | 黒の夢 | メガミュータント、ギガミュータント |
| 26 | 星の夢の終わりに | — | ラヴォスの体内 | ラヴォス・本体、ラヴォス コア |
章ごとのあらすじと要点
第1〜5章｜千年祭から王国裁判まで
トルース町の千年祭でマールと出会い、ルッカの転送装置の実験でゲートが開きます。マールを追って中世へ渡り、王妃リーネを救い出すのが第2〜3章です。
第1章の行動が第5章の裁判に影響します。ペンダントを拾う前にマールに話しかける、ペンダントを返すときに断らない、鐘の広場に置いてあるおべんとうを食べない——こうした行動の積み重ねで、陪審員の判決が変わります。無罪になった場合は、無罪と判断した陪審員の人数に応じて牢獄のベッドに差し入れが置かれます。
| 無罪と判断した陪審員 | 差し入れ |
|---|---|
| 4人 | エーテル |
| 5人 | エーテル×2 |
| 6人 | エーテル×3 |
| 7人 | エーテル×6 |
第6〜9章｜未来と時の最果て
ガルディアの森のゲートから未来へ飛ぶと、ラヴォスに焼かれたあとの世界に着きます。地下のコンピュータでA.D.1999の災害を目にするのが物語の転換点です。ロボを仲間に加えて工場跡の電源を入れ、時の最果てへ。ここでスペッキオから魔法を教わります。
時を超えられるのは3人までです。時の最果てで仲間をひとり残していくことになります。
第10〜15章｜伝説の勇者とグランドリオン
中世のゼナンの橋で騎士団に加勢し、デナドロ山で折れた剣を手に入れます。修復にはドリストーンが必要で、それを求めて原始へ渡るのが第12章です。原始時代はここで初めて訪れます。
ボッシュの手でグランドリオンが修復されると、カエルが魔王討伐を決意します。魔王城では三大将軍と戦い、ラヴォスを呼び出す儀式の直前に魔王のもとへたどり着きます。
第16〜23章｜原始・古代とジールの滅び
ラヴォスが生み出したゲートで原始へ飛ばされ、恐竜人との決着をつけたあと、ティラン城跡のゲートから古代へ。魔法王国ジールの繁栄の裏にラヴォスの存在があることが明かされます。
第19章では古代へのゲートが封印されるため、未来にある封印された扉をペンダントで開けて回り道をします。なげきの山でギガガイアを倒し、ジール宮殿でダルトンを退けたあと、海底神殿でラヴォスとの決定的な出来事を迎えます。
第24〜26章｜時の卵から最終決戦へ
時の賢者ハッシュから時の卵「クロノ・トリガー」を受け取り、死の山へ向かいます。ここから先はシルバードで自由に移動できるようになり、マルチイベントの大半がこの時点で開放されます。
黒の夢は4つの時代すべてに出現します。どの時代から入っても中身は同じですが、未来だけはレーザーサイトを倒しても内部に入れないため、ほかの3つの時代から入ります。
寄り道できるマルチイベント
本編とは別に、9つのマルチイベントがあります。多くは第24章以降にシルバードで自由に動けるようになってから挑めます。どれを片づけてから最終決戦に臨むかで、エンディングの内容が変わります。
| 記号 | イベント名 | 備考 |
|---|---|---|
| A | 緑の夢 | — |
| B | ビネガーの館 | クリアするとメディーナ村の住人が友好的になる |
| C | ジェノサイドーム | テラパワーアーム・クライシスアームを入手できる |
| D | 太陽石 | クリアするとミラクルショットを入手できる |
| E | 勇者の墓 | クリアするとグランドリオンが覚醒する |
| F | 虹色の貝がら | 太陽石とあわせてクリアすると「虹」を入手できる |
| G | 竜の聖域 | DS版で追加。依頼10件をこなす |
| H | 次元のゆがみ | DS版で追加。古代・現代・未来の3か所 |
| I | 時の闇 | DS版で追加。3つの次元のゆがみを全クリアで開放。クリアすると「夢幻」を入手できる |
時代ごとの主な場所
| 時代 | 訪れる場所 |
|---|---|
| 原始 B.C.65000000 | 不思議山／イオカ村／かりの森／まよいの森／恐竜人アジト／ラルバ村のやけ跡／プテランの巣／ティラン城／ティラン城跡 |
| 古代 B.C.12000 | エンハーサ／カジャール／黒鳥号乗り場／ジール宮殿／地の民の洞窟／ドロクイの巣／なげきの山／海底神殿／残された村／黒鳥号／北の岬 |
| 中世 A.D.600 | トルース村の裏山／トルース村／ガルディアの森／ガルディア城／マノリア修道院／ゼナンの橋／サンドリノ村／お化けガエルの森／パレポリ村／デナドロ山／魔岩窟／魔王城 |
| 現代 A.D.1000 | トルース町／リーネ広場／ルッカの家／ゼナンの橋／パレポリ町／ガルディアの森／空中刑務所／メディーナ村／ボッシュの小屋／ヘケランの洞窟／北の森の遺跡 |
| 未来 A.D.2300 | バンゴドーム／トランドーム／16号廃墟／アリスドーム／地下水道跡／32号廃墟／プロメテドーム／工場跡／監視者のドーム／死の山 |
| そのほか | 時の最果て／黒の夢／ラヴォスの体内 |